A l’ère du numérique, le déploiement de nouveaux systèmes d'information reste un enjeu stratégique fort pour les entreprises. L'objectif est de profiter de nouvelles solutions numériques afin d'améliorer les processus, l'organisation et la performance. Toutefois, leur mise en place reste complexe et l'organisation doit logiquement se renouveler, notamment par l'innovation, pour s'adapter à de nouveaux usages et fonctionnements. En ce sens, l'innovation organisationnelle peut être une voie privilégiée mais la relation de causalité avec le déploiement d'un nouveau système d'information reste mal comprise par la litérature. Cette recherche s'intéresse au cas du Manufacturing Execution System (MES), qui reste un objet de recherche peu étudié comparativement à l’Enterprise Resources Planning (ERP). A travers une démarche qualitative et l'analyse du déploiement d'un MES chez un fournisseur aéronautique, nous mettons en évidence la dynamique de causalité mutuelle entre le processus d'implémentation d'un MES et l'innovation organisationnelle, incluant les facteurs déclencheurs de cette causalité.
